Küberneetika Instituudi doktorandid 31.12.2016 seisuga
| Doktorant | Juhendaja(d) | Õppekava | Alustanud |
| Jelena Branovets | Rikke Birkedal | YALD02 | 2009 |
| Maris Eelsalu | Tarmo Soomere, Artu Ellmann | EAED02 | 2013 |
| Oksana Goidyk | Heiko Herrmann | EAED02 | 2016 |
| Natalja Jepihhina | Marko Vendelin | YALD02 | 2009 |
| Svetlana Jugai | Rikke Birkedal | YALD02 | 2013 |
| Martin Lints | Andrus Salupere, Serge dos Santos (INSA Centre Val de Loire) | YAFD06 | 2013 |
| Hendrik Maarand | Tarmo Uustalu | YAQD02 | 2015 |
| Indrek Mandre | Jaan Kalda | YAFD06 | 2010 |
| Rain Männikus | Tarmo Soomere | EAED02 | 2015 |
| Katri Pindsoo | Tarmo Soomere | EAED02 | 2013 |
| Paavo Põld | Robert Kitt | TADD02 | 2005 |
| Stephanie Rendon de la Torre | Jaan Kalda | YAFD06 | 2014 |
| Andri Saar | Tarmo Uustalu, Keiko Nakata | IAQD02 | 2009 |
| Ivan Sertakov | Jaan Janno, Jüri Engelbrecht | YAFD06 | 2010 |
| Päivo Simson | Pearu Peterson, Marko Vendelin | YAFD06 | 2011 |
| Boriss Šelajev | Tarmo Uustalu | IAQD02 | 2011 |
| Andres Toom | Tarmo Uustalu, Marc Pantel (INP Toulouse) | IAQD02 | 2007 |
| Asad Ullah | Tanel Alumäe | IAQD02 | 2016 |
| Niccolò Veltri | Tarmo Uustalu, James Chapman | IAQD02 | 2012 |
Küberneetika Instituudis töötavad teised doktorandid 31.12.2016 seisuga
| Doktorant | Juhendaja(d) | Õppekava | Alustanud |
| Kristiina Kindel (TTÜ arvutitehn inst) | Ahto Kalja | IAQD02 | 2002 |
| Margarita Spitšakova (TTÜ arvutitead inst) | Jaan Penjam | IAQD02 | 2007 |
| Ottokar Tilk (TTÜ inform inst) | Leo Võhandu, Tanel Alumäe | IAQD02 | 2012 |
Küberneetika Instituudi töötajate juhendatavad teised doktorandid 31.12.2016 seisuga:
| Doktorant | Juhendaja(d) | Õppekava | Alustanud |
| Siim Ainsaar (TÜ füüsika inst) | Jaan Kalda, Teet Örd | ||
| Sergei Avanessov (TTÜ automaatika inst) | Ülo Nurges, Ennu Rüstern | IAQD02 | 2007 |
| Jakob Jõgi (TÜ füüsika inst) | Alexey Romanov, Ants Lõhmus, Jaan Kalda | ||
| Mihkel Heidelberg (TÜ füüsika inst) | Jaan Kalda, Teet Örd | ||
| Christian Meurer (TTÜ biorobootika keskus) | Maarja Kruusmaa, Ülle Kotta | IAQD02 | 2016 |
| Andrus Paats (TTÜ biomed-tehn inst) | Ivo Fridolin, Einar Meister | YAFD06 | 2013 |
| Chatraee Shahabedin (TÜ füüsika inst) | Vladimir Hižnjakov, Jaan Kalda | ||
| Iram Tufail (TTÜ füüsika inst) | Jaan Kalda, Matti Laan | YAFD06 | 2015 |